К системным относятся нововведения, которые касаются не одной, а нескольких функций управления качеством и вызывают необходимость внесения изменений в содержание элементов системы. Системные нововведения могут касаться одной функции, но по масштабам влияют на другие функции, что приводит к необходимости внесения в них изменений. В данном случае при изготовлении запасных частей для железнодорожных вагонов возможный переход от сдельной формы оплаты труда к погодинной или погодинно-преміальної. Известно, что сдельная оплата труда во многих случаях негативно влияет на качество изготовления и в определенный момент времени, когда качество начинает опускаться ниже допустимого предела. Возникает необходимость от этой системы отказаться и перейти к погодинной или смешанной оплате труда. Такое нововведение входит в состав функции управления качеством – материального стимулирования улучшения качества. Изменение формы оплаты труда коснется других функций – технологической подготовки производства, контроля качества, а по масштабам повлияетна очень большую группу участников процесса обеспечения качества.
С помощью классификации нововведений более легко определить адресность в реализации нововведений. Функцию нововведения осуществляет подразделу аппарата управления – технические, технологические службы, отделы кадров и оплаты, труды, ответственные за реализацию тех или других задач управления качеством.
Системные нововведения проводятся руководством, администрацией высшего уровня, чем функциональные органы управления. Это объясняется необходимостью координации внесения изменений (одновременно или в определенной последовательности) в деятельность разных служб и подразделов.